Towarzystwo powstało w Poznaniu w 1996 roku. Z inicjatywą utworzenia organizacji kultywującej pamięć i twórczość Feliksa Nowowiejskiego - wielkiego poznańskiego kompozytora, dyrygenta i organisty-wirtuoza, którego dzieła zyskały światowy rozgłos, wystąpili miłośnicy jego muzyki. Ideę tę poparto wiele osób. stając się następnie członkami założycielami Towarzystwa. Wśród nich są m.in.: Jan Nowowiejski, ostatni żyjący syn Patrona, Rektor Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu. Rektor Akademii Muzycznej im. l. J. Paderewskiego. Dyrektor Filharmonii Poznańskiej, kompozytor prof. Andrzej Koszewski oraz liczni przedstawiciele kręgów muzycznych, muzealnych, dziennikarskich oraz prawniczych.
Zgodnie ze swym statutem Towarzystwo stawia sobie następujące cele:
- inspirowanie i organizowanie polskiej kultury muzycznej, w szczególności zaś szerzenie i pogłębianie wiedzy o Feliksie Nowowiejskim oraz upowszechnianie jego twórczości w Polsce i za granicą,
- promowanie poprzez muzykę Poznania i Wielkopolski w kraju i za granicą.
- popularyzowanie muzyki organowej,
- troskę o zabytkowe organy i ich właściwą renowację.
- promocję młodych artystów-muzyków, zwłaszcza organistów.
Towarzystwo zrealizowało dotychczas następujące przedsięwzięcia:
1. pięć międzynarodowych konkursów organowych,
2. szesnaście Festiwali Muzyki Pasyjnej i Paschalnej w kościołach i salach kameralnych Poznania i Wielkopolski,
3. obchody rocznicowe, m.in. z okazji 100-lecia skomponowania i prawykonania piesni "Rota", obchody Roku Feliksa Nowowiejskiego 2016/2017 - 70-rocznicy śmierci oraz 140-rocznicy urodzin Kompozytora
- koncerty wokalne oraz chóralne i wokalno-instrumentalne muzyki F. Nowowiejskiego w salach koncertowych i kościołach Poznania i Wielkopolski,
- wykonanie trzech oratoriów: Quo Vadis, Znalezienie św. Krzyża, Powrót Syna Marnotrawnego,
4. wystawy poświęcone życiu i twórczości F. Nowowiejskiego w wielu miejscach Poznania i róznych miejscowosciach na terenie kraju
5. wydanie książki Ojciec Anioł - czyli wspomnienia o Feliksie Nowowiejskim,
6. wydanie płyt: Boże Narodzenie Feliksa Nowowiejskiego; Feliks Nowowiejski - Ojczyźnie. Muzyka patriotyczna, Feliks Nowowiejski - znany i nie znany; W Salonie Muzycznym Feliksa Nowowiejskiego; O pczyczyń sie za nami - Muzyka religijna Feliksa Nowowiejskiego i ks. Waclawa Gieburowskiego, IV Miedzynarodowy Konkurs Organowy im. Feliksa Nowwoeijskiego 2010 - The Gala Winners' Concert; Feliks Nowowiejski - Inspiracje;
; Tu sie wszytsko zaczęło - z okazji Roku Feliksa Nowowiejskiego i 150. rocznicy chrztu Polski; 7. wydanie albumu nutowego z kolędami oraz nowych opracowań utworów organowych Feliksa Nowowiejskiego - I Symfonia, VI Symfonia, VII Symfonia "DISPUTA", poemat "In Paradisum" IX Symfonia oraz Wizja na skrzypce i organy, a także Utwory Fortpeianowe;
8. współorganizowanie cykli Letnich Koncertów Sołackich;
9. obchody 100. rocznicy skomponowania i prawykonania "ROTY" (2010 rok - informacja w specjalnej zakładce).
Od 7 lutego 2008 roku Towarzystwo prowadzi Salon Muzyczny - Muzuem Feliksa Nowowiejskiego w domu Kompozytora na poznańskim sołaczu zwanym "Willą Wśród Róż", w którym oprócz działalności muzealnej realizowane są cykle koncertowe oraz projekty edukacyjne (informacja w specjalnej zakładce).
Większość zrealizowanych dotychczas przedsięwzięć uzyskała wsparcie finansowe Władz Miasta Poznania, Urzędu Marszałkowskiego Województwa Wielkopolskiego oraz Mnistzerstwa Kultury i Dziedzicwa Narodowego